本硕都在海外，本科时期挂靠深圳的亲戚公司交了社保，没有产生劳动关系或签订劳动合同。而后硕士在读期间停交，毕业之后可能要去北上，很担心影响落户或者应届生身份。

北京落户不太了解，仅回答一下上海落户。

留学期间缴过社保会影响到上海留学生落户。人社局会认为你可能不是全日制留学，质疑你的学历真实性。所以即便没有签订正式劳动合同，落户也会出现问题，人社局只看社保记录。唯一的解决办法是提前递交合理的情况说明，解释你为什么留学期间有社保记录。如果解释不被人社局认可也是通过不了落户审批的。需要情况说明处理可以s信我。

应届生身份在上海除非考公，一般不会受到影响。